真菌孢子萌发产生芽管，芽管直接接触或芽管先端膨大形成附着器附着寄主，附着器产生侵染丝直接穿过寄主表皮角质层和细胞外壁。侵染丝形成菌丝，完成侵入过程。
真菌、细菌和病毒各通过什么途径侵染植物？水源，土壤，空气，昆虫。真菌一般分解死亡植物，或寄生在树木上。细菌貌似不感染植物体。病毒在活体植物上寄生，一般在植物缺少某些微量元素时才会感染。也有某些病毒在正常情况下也会严重影响植物的生长。
真菌对植物有起到的影响有哪些？
真菌是一群多细胞低等生物，体内无叶绿素，不能自制养分，通常营寄生和腐生生活。真菌种类繁多，分布极广，与人类关系密切。有的种类对人类有益，也有些种类对人类有害，在农业生产中，约有80%的植物病害是由真菌引起的。
真菌的结构比细菌复杂。真菌的细胞中有细胞核，其繁殖能力很强，繁殖方式很多。不经过有性过程而产生后代，称为无性繁殖，如粉孢子、芽孢子、厚垣孢子和分生孢子。有性繁殖产生有性孢子，如接合孢子、子囊孢子和担孢子。
植物病原真菌是由真菌的各种繁殖体如分生孢子、子囊孢子等萌发后，从植物的表层细胞直接侵入危害而致植物生病的。
真菌引起的植物病害，常表现叶斑、溃疡、根腐、猝倒、软腐、炭疽、疮痂、萎蔫、锈斑、霜霉、白粉等症状。
植物真菌病是怎么引起的？植物真菌病:由植物病原真菌引起的病害。约占植物病害的70~80%。一种作物上可发现几种甚至几十种真菌病害。常见有霜霉、白粉、白锈、黑粉、锈粉、烟霉、黑痣、霉状物、蘑菇状物、棉絮状物、颗粒状物、绳索状物、粘质粒和小黑点等。
病征的出现与寄主的品种、器官、部位、生育时期、外界环境有密切关系。田间主要通过气流、水流传播;此外，风、雨、昆虫也可传播真菌病害。
防治
由于真菌性病害的气流和水流传播较突出,一般多采用化学药剂进行保护性防治，或通过改进栽培管理措施，施用碧卡菌肥+有机肥改良土壤，用各类药剂加以防治(见化学防治、农业防治)。
植物组培真菌污染的原因植物组培是在无菌条件下进行的，若有微生物进入培养瓶中，引起污染，组织培养将无法进行[2]。污染主要是真菌、细菌引起的。真菌在培养条件下生长快，很容易观察到，一般在接种3～5 d后出现，主要症状是培养基表面或材料附近出现绒毛状菌丝，然后形成不同颜色的孢子层，黑色、白色和黄色的孢子层较多见。孢子层从培养基表面长起，逐渐沿着瓶身长到瓶盖，甚至漫延到瓶外。孢子在空气中扩散，对培养室造成严重污染。所以发现受到真菌污染的瓶苗，要即时清除出培养室，防止其变成一个污染源，引起其它瓶苗污染。真菌污染主要是由于培养室和接种室的空气受污染或者室内环境不卫生造成，它的重要特点是发展迅速、难控制。
细菌潜伏期长，很难在前期肉眼观察到，一般5～10 d后，会在培养基表面、材料附近或在培养基里面形成（多见白色、黄色）黏液状菌斑、鼻涕状或丝状的菌落，混浊水迹并伴有发酵状泡沫。其原因是由于使用了未消毒完全的工具引起，也可能是操作人员呼吸排出的气体中带细菌或培养材料带细菌等。